SPY x FAMILY nos sitúa en un mundo en guerra entre los países de Westalis y Ostania, donde ambos países despliegan sus mejores herramientas de inteligencia y espionaje. Entre todos los espías destaca especialmente Twilight, el mejor agente de Westalis, que en esta ocasión tendrá una importante misión: encargarse del poderoso político de Ostania, Donovan Desmond. Desgraciadamente, Desmond es un paranoico de la seguridad y las únicas apariciones públicas que realiza son los actos escolares de su hijo, en el elitista colegio Eden. Por esto, la única forma que tiene Twilight de acercarse a Donovan es simular ser un padre de familia.
Bajo la identidad falsa de Loid Forger, Twilight tendrá que montar una familia en solo 7 días. Para ello adoptará a la huérfana Anya como su hija y convencerá a la civil Yor Briar para que se haga pasar por su esposa. Irónicamente, ambas también tienen un secreto: Yor es una asesina a sueldo, conocida como Thorn Princess y Anya es una esper, prófuga de un laboratorio secreto, capaz de leer la mente de la gente.
